Senatfastigheter har fyra affärsområden som arbetar under eget resultatansvar:

Ministerier och specialfastigheter 
Försvar och säkerhet
Kontor
Utvecklingsfastigheter

I linje med Senatfastigheters strategi har indelningen i affärsområden gjorts utifrån kunder med likartade verksamheter och servicebehov. Syftet är att skapa ett mer kundfokuserat och kostnadseffektivt sätt att arbeta. Affärsområdena har ett centralt ansvar för sina egna kundsegment och frågor som anknyter till det. Hit hör byggprojekt, upphandling för fastigheterna, strategisk planering samt markanvändning.